La Dirección de Coordinación Institucional asiste a la Secretaría en el fortalecimiento de las relaciones institucionales con los Poderes Ejecutivo, Legislativo y Judicial.
Tiene a su cargo la Oficina de Enlace con Organismos Nacionales que realiza, de forma rápida y eficaz, trámites frente a organismos nacionales y de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires, tanto para Juzgados, Fiscalías y Defensorías como para magistrados, funcionarios y empleados del Poder Judicial.